ウェイン郡（英: Wayne County）は、アメリカ合衆国ミズーリ州の南東部、オザーク・フットヒルズ地域に位置する郡である。2010年国勢調査での人口は13,521人であり、2000年の13,259人から2.0％増加した。郡庁所在地はグリーンビル市（人口511人[2]）であり、同郡で人口最大の都市はピードモント市（人口1,977人[3]）である。ウェイン郡は1818年12月11日に組織化され、郡名はアメリカ独立戦争で活躍した"マッド"・アンソニー・ウェイン将軍に因んで名付けられた。

ウェイン郡は1818年にミズーリ準州最後の議会によってケープジラード郡とローレンス郡の一部を合わせて設立された。ミズーリが州に昇格する前のことだった。1819年3月、連邦議会はアーカンソー準州を設立し、ローレンス郡の大半がアーカンソー準州ローレンス郡となった。ミズーリ州内で行き先の無くなった「昔のローレンス郡」の小さな領域が、1820年のミズーリ州憲法によってウェイン郡に付加された。カンザス州州境にそったオーセージ・ストリップは1825年に付け加えられた。1825年から1831年、ウェイン郡はマサチューセッツ州、コネチカット州、ロードアイランド州、デラウェア州を合わせたよりも広い広大な郡だった。ミズーリ州の郡のうち32郡はその全体あるいは一部がウェイン郡の一部だったことがある。

ウェイン郡が形成されたとき、郡政府を任せる5人の委員が指名された。彼らはじもとでシーダーキャビンと呼ばれていたセントフランシス川沿いの地を郡庁所在地に選定し、グリーンビルと名付けた。1900年、グリーンビルの人口は約1,000人だった。1942年にはそれが572人まで減っていた。この町はワッパペロ湖の造成によって1941年に場所を移したので、1950年の人口は270人しかいなかった。今日500人強がグリーンビルを故郷としている。

ウェイン郡庁舎は1854年に焼失した。新しい郡の記録文書は1866年に盗まれ、1892年には郡庁舎が再度焼けた。1820年の国勢調査では、ウェイン郡の大きな領域に1,239人の白人と204人の奴隷がいるとされていた。

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